泡染法
(1) 按照常規方法進行電泳。
(2) 用H2O將MKRed 10,000× 儲液稀釋約3,300倍到0.1M NaCl中,制成3× 染色液。(例如將15μL MKRed 10,000× 儲液和5mL 1M NaCl加到45mL H2O中)。
(3) 將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3× 染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右,zui合適染色時間根據凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時間通常介于30min到1h,并隨丙烯酰胺含量增加而延長。
1、此方法染色染料用量相對較少。500 μL染料大約可以做100塊 50mL的膠。
2、由于MKRed具有良好的熱穩定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉以保證染料充分混勻。也可以選擇將MKRed儲液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中,然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。MKRed兼容所有常用的電泳緩沖溶液。
3、如果總是看到條帶彌散或分離不理想,建議使用泡染法染色以確認問題是否與染料有關。如果染色后問題依舊存在,則說明問題與染料無關,請嘗試:降低瓊脂糖濃度;選用更長的凝膠;延長凝膠時間以保證邊緣清晰;改進上樣技巧或選擇泡染法染色。
4、此方法不適合預制聚丙烯酰胺凝膠,對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。
注意事項:
1、用泡染法染色時,染料用量較多。單次使用的染色液可重復使用3次左右。
2、3× MKRed染色液可以大量制備,在室溫下避光保存直至用完。